微生物感染對(duì)免疫功能的影響是多方面的，有些感染可增強(qiáng)免疫功能，免疫接種即建立在此理論基礎(chǔ)上。有些所謂“正常菌群”，如雙歧桿菌、乳酸桿菌、大腸桿菌、寄生在腸道中對(duì)人體健康是有益的，甚至是必不可少的。這些感染的過(guò)程的最終結(jié)果是增強(qiáng)抗感染免疫功能。

還有很情況下，感染會(huì)削弱免疫功能。如麻疹患兒、流感患者有容易并發(fā)肺炎的傾向；風(fēng)疹、水痘、脊髓灰質(zhì)炎、巨細(xì)胞病毒感染、流行性腮腺炎后，可使免疫力下降，易繼發(fā)其他感染。艾滋病毒感染會(huì)嚴(yán)重破壞免疫系統(tǒng)，從而繼發(fā)感染或腫瘤。

另有一些感染會(huì)造成調(diào)節(jié)紊亂，引發(fā)超敏反應(yīng)（俗稱(chēng)“過(guò)敏”）及自身免疫病，如有些人在鏈球菌感染后會(huì)引起腥紅熱，有些則在感染過(guò)去后數(shù)月甚至數(shù)年出現(xiàn)風(fēng)濕性心臟病和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎，甚至發(fā)生腎炎。

不同微生物感染人體后，其結(jié)果各不相同，而有時(shí)同一種感染對(duì)免疫系統(tǒng)的影響也因人而異。另外，需要提醒的是，某些活疫菌接種后會(huì)在一段時(shí)期內(nèi)降低機(jī)體免疫功能，發(fā)生接種后反應(yīng)，這一點(diǎn)也是不應(yīng)忽視的。