細菌的分類方法：

（一）生理學與生物化學分類法

細菌的形態(tài)，染色以及細菌的特殊結構是最早和最基本的分類依據(jù)；而細菌的生理生化特征一直作為分類的主要依據(jù)。

目前，以生理生化學作細菌分類的廣泛采用方法有兩種，即傳統(tǒng)分類法和數(shù)值分類法醫(yī)學|教育網搜集整理。

1.傳統(tǒng)分類法：傳統(tǒng)分類的原則是將生物的基本性質分為主要的和次要的（主次原則），然后將主次順序一級一級地往下分，直至最小區(qū)分。按細胞形態(tài)、革蘭染色性、鞭毛及代謝特點作為較高一級分類依據(jù)。科、屬、種水平的分類主要依靠生化特性和抗原結構。

2.數(shù)值分類法：數(shù)值分類法集數(shù)字、電子、信息及自動化分析技術于一體，將細菌的一些基本性質視為同等重要（等重要原則），采用標準化、成品化和配套生化反應試劑條，檢測細菌的數(shù)十個生理生化特性。每個細菌都能產生一套陰陽性結果，然后轉換成數(shù)字，通過電子計算機進行復雜計算，比較每一株與其他類同株，測定其相似度。根據(jù)相似度，區(qū)分細菌的種群，并確定各種細菌的親緣關系。

（二）遺傳學分類法

遺傳學分類是以細菌的核酸、蛋白質等在組成的同源程度分類。該分類法具有下述的優(yōu)點：①對細菌的“種”有一個較為一致的概念；②使分類不會出現(xiàn)經常性或根本性的變化；③可制定可靠的細菌鑒定方案；④有利于了解細菌的進化和原始親緣關系。目前較為穩(wěn)定的應用遺傳學的細菌分類方法有下列幾種：

1.DNA G+Cmol%測定。

2.核酸同源值測定醫(yī)學|教育網搜集整理。

3.核糖體RNA堿基序列測定。