方藥中1921年10月14日出生于四川省重慶市。

1940年，拜門于“南京四大名醫(yī)”之一、醫(yī)學(xué)教|育網(wǎng)搜集整理清代著名醫(yī)家陳修園后裔陳遜齋學(xué)習(xí)中醫(yī)。陳老為其更名為“方藥中”，勉勵他“要一生沉潛于方藥之中”，并取“方藥必能中病”之意。

1944年出師后，經(jīng)考試和審批，取得了“中醫(yī)師證書”和“執(zhí)業(yè)證書”，在重慶市開設(shè)“方藥中診所”。主治脾胃病及內(nèi)、婦、兒、針各科。業(yè)醫(yī)同時，在《中國醫(yī)藥月刊》上發(fā)表文章，論述中醫(yī)理論，反對借“中醫(yī)科學(xué)化”之名，行消滅中華文化，消滅中醫(yī)之實。