我國近代微生物學(xué)的啟蒙時期是在十九世紀末。西方和日本學(xué)者對我國微生物學(xué)的早期發(fā)展曾起過重要作用。十九世紀80年代出版的一篇題為“人與微生物爭戰(zhàn)論”的講演記錄的譯文，文中談到疾病由“極細微之生物所成”，可能這是近代微生物學(xué)由西方傳入中國的最早文字記載。20世紀初，西方學(xué)者開始在我國的一些研究所從事醫(yī)學(xué)微生物學(xué)的研究，在一些高等院校開設(shè)有關(guān)課程，一批日本學(xué)者開始對我國的發(fā)酵產(chǎn)品，特別是我國酒曲微生物進行了較系統(tǒng)的研究。同時，一批到西方留學(xué)的中國科學(xué)家開始較系統(tǒng)地介紹微生物學(xué)知識。中國學(xué)者從事實際研究工作的，當首推伍連德，他在1910-1921年間用近代微生物學(xué)知識對鼠疫和霍亂病原的探索和防治，并總結(jié)了鼠疫流行的基本規(guī)律，提出了檢疫措施，在中國最早建立了衛(wèi)生防疫機構(gòu)，培養(yǎng)了第一支預(yù)防鼠疫的專業(yè)隊伍，在當時，這項工作居于國際領(lǐng)先地位，在國際上產(chǎn)生了很大的影響。30年代，我國學(xué)者開始對醫(yī)學(xué)微生物學(xué)有了較多的實驗研究，主要是在湖南湘雅醫(yī)學(xué)院和北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的細菌學(xué)系進行的，在那里培養(yǎng)了我國第一批醫(yī)學(xué)微生物學(xué)家，如余賀、湯飛凡、謝少文、魏曦等，在醫(yī)學(xué)細菌學(xué)、病毒學(xué)和免疫學(xué)等方面的個別領(lǐng)域做出過較高水平的成績。魏巖壽是我國近代開始從事非醫(yī)學(xué)微生物的應(yīng)用微生物學(xué)研究的先驅(qū)。當時的實業(yè)部南京中央工業(yè)試驗所和黃?；瘜W(xué)工業(yè)社分別設(shè)立了釀造研究室和菌學(xué)研究室，在我國工業(yè)微生物學(xué)的早期發(fā)展中起了重要的作用。1922年戴芳瀾等開始在我國介紹植物病害微生物，到30年代，張憲武、陳華癸等對土壤微生物，特別是根瘤菌固氮作用的研究，是我國農(nóng)業(yè)微生物學(xué)研究的開始。不過，直到20世紀40年代后期，我國的微生物學(xué)研究和應(yīng)用只有零星的工作，未形成我國自己的隊伍和研究體系醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

　　新中國成立后的第一個十年，微生物學(xué)在我國有了劃時代的發(fā)展。一批主要進行微生物學(xué)研究的單位建立起來了，抗生素、酒精廠等現(xiàn)代微生物工業(yè)在我國的誕生向微生物學(xué)工作者提供了展示才能的機會，一些重點大學(xué)建立了微生物學(xué)專業(yè)，開始有計劃地培養(yǎng)微生物學(xué)工作者。在這十年中，選育了一批優(yōu)良菌種，促進了醫(yī)藥工業(yè)和發(fā)酵工業(yè)的發(fā)展，獲得了一些新抗生素以防治人的疾病和動植物的病害，大量培植和推廣了根瘤菌、好氧性固氮菌和分解有機磷細菌，開展了利用微生物勘探石油的工作。在控制有害微生物方面，研究了傳染病的流行規(guī)律，研制出多種疫苗，尤其是湯飛凡等分離并確證了沙眼病原體，是具有國際領(lǐng)先水平的開創(chuàng)性工作。在農(nóng)業(yè)微生物學(xué)領(lǐng)域，研究了主要農(nóng)作物及家畜家禽和養(yǎng)殖魚類的病害及防治對策，還進行了工業(yè)原料防霉的研究。60年代，根據(jù)國家12年科學(xué)發(fā)展規(guī)劃，進行了許多理論性研究的初步工作，現(xiàn)代化的發(fā)酵工業(yè)、抗生素工業(yè)和農(nóng)藥、菌肥工業(yè)已經(jīng)形成一定規(guī)模。在70年代國內(nèi)政治氣候非常不正常的年代，曾經(jīng)在全國出現(xiàn)過一個應(yīng)用微生物的熱潮。農(nóng)村中大力推廣發(fā)酵飼料、菌肥、植物生長刺激素、沼氣發(fā)酵和食用菌栽培；在食品、皮革、紡織、造紙等工業(yè)部門推廣微生物酶制劑，味精工業(yè)在此期間建立起來并得到較大發(fā)展，抗生素工業(yè)也有了大發(fā)展。用石油原料發(fā)酵生產(chǎn)工業(yè)產(chǎn)品也在這一時期進行過研究。雖然當時受到極“左”思想的嚴重影響，出現(xiàn)過許多違背科學(xué)的荒唐做法，但客觀上使廣大群眾對微生物與人類的關(guān)系有了較全面的認識，而且廣大群眾在微生物育種和培養(yǎng)等方面有過一些創(chuàng)造。許多研究微生物的機構(gòu)在此時建立起來了，不過多數(shù)只從事簡單的應(yīng)用性技術(shù)工作。

　　改革開放的20年中，我國的微生物學(xué)和其它科學(xué)一樣，進入了一個全面發(fā)展的新時期。為迎接新世紀的到來，本著有所為有所不為的原則，我們在微生物資源的調(diào)查和開發(fā)、微生物次生代謝的研究、微生物與植物相互作用的研究、微生物致病與免疫機理的研究以及病毒的結(jié)構(gòu)、功能及與宿主關(guān)系的研究作為當前的重點課題。隨著創(chuàng)新工程的逐步推進，我國的微生物學(xué)將會有較大的發(fā)展。