北醫(yī)設(shè)有5個學院（部）：基礎(chǔ)醫(yī)學院、藥學院、公共衛(wèi)生學院、護理學院、公共教學部（醫(yī)學人文研究院），6家附屬醫(yī)院、4家共建醫(yī)院和14家教學醫(yī)院，承擔臨床醫(yī)學的教學、實習任務(wù)和向社會提供醫(yī)療保健服務(wù)。

北醫(yī)共有全日制在校學生8642人，其中博士生2204人，碩士生2514人，本科生3419人，?？粕?人，留學生354人，臺港澳僑學生149人；非全日制學生中，成人教育學生1949人，網(wǎng)絡(luò)教育學生19224人。另外，博士后在站人數(shù)110人，2015年累計出站597人。

北醫(yī)擁有大批國際、國內(nèi)知名的醫(yī)學教育、研究、臨床方面的專家，其中具有高級職稱1076人，兩院（中國科學院、中國工程院）院士12人，”973“計劃和重大科學研究計劃項目首席科學家19人，”長江學者獎勵計劃“特聘教授、講座教授18人，博士生導(dǎo)師530人，入選人力資源社會保障部”新世紀百千萬人才工程“國家級人選8人，入選教育部”新世紀人才支持計劃“70人，國家杰出青年基金獲得者33人。

北醫(yī)目前擁有3個國家一級重點學科，12個國家二級重點學科，1個國家重點實驗室，1個國家工程實驗室，2個國家臨床醫(yī)學研究中心，40個省部級重點實驗室和研究中心，4個北京市國際科技合作基地。2011年至2015年度，醫(yī)學部承擔獲批各類縱向科研課題2083項，批準經(jīng)費（部分為預(yù)算額）19.101億元。近五年以北醫(yī)為主要作者單位發(fā)表的SCI論文數(shù)6347篇，最高影響因子53.48，一批高水平的論文和綜述在《細胞》（Cell）、《科學》（Science）等國際頂尖雜志發(fā)表。

2011年到2015年五年間，北大醫(yī)學部作為第一完成單位，共獲得各級各類科技獎勵171項。其中國家級科技獎勵9項（包括國家自然科學二等獎3項、國家科技進步二等獎6項），省部級科技獎勵59項（包括北京市科學技術(shù)獎24項、教育部高等學校科學研究優(yōu)秀成果獎35項）以及社會力量設(shè)獎103項。2011-2015年度，共申請專利719項，獲得授權(quán)546項，其中國內(nèi)專利534項，國際專利12項。醫(yī)學部是我國最重要的醫(yī)學創(chuàng)新研究基地和高級醫(yī)藥衛(wèi)生人才的培養(yǎng)基地之一。

北醫(yī)對外交流活動豐富，與國際上著名的大學和科研機構(gòu)在人才培養(yǎng)、科學研究、學術(shù)研討等方面開展了廣泛的交流與合作。如互派人員進修與交流、舉辦大型國際學術(shù)會議、邀請國外、境外知名學者做各類學術(shù)報告、與國外著名大學和科研機構(gòu)搭建高水平的學術(shù)交流平臺。北醫(yī)已與100多所海外高校和機構(gòu)建立了合作關(guān)系，其中有40余所為北醫(yī)戰(zhàn)略合作伙伴，如美國的密歇根大學、倫敦國王學院、曼徹斯特大學、愛丁堡大學，奧斯陸大學、杜克大學等。交流合作的主要形式從以教授與教授間合作的單一模式逐漸轉(zhuǎn)為以教授（實驗室）與教授（實驗室）合作為基礎(chǔ)，重點支持校方合作框架下的團隊合作模式，并逐漸傾向于有目的、有重點、有步驟的強強實質(zhì)性合作。建立了多個中外合作中心，例如“北京大學醫(yī)學部-密歇根大學醫(yī)學院轉(zhuǎn)化醫(yī)學與臨床研究聯(lián)合研究所”、“北京大學醫(yī)學部-曼徹斯特學術(shù)醫(yī)學中心醫(yī)學遺傳聯(lián)合研究中心”、“北京大學醫(yī)學部-烏爾姆大學神經(jīng)科學聯(lián)合研究中心”、“北京大學醫(yī)學部-英國倫敦國王學院醫(yī)學研究聯(lián)合研究所”等。設(shè)立了28個學生交流活動項目，與17所協(xié)議學校建立了MD-PhD項目，設(shè)立了10余項國際交流獎學金項目，搭建起國際醫(yī)學教育資源共享的平臺。通過與中華醫(yī)學基金會、WHO、NIH、CDC、世界銀行等國際機構(gòu)保持的良好工作關(guān)系，獲得了更多的科研與人才培訓(xùn)基金。廣泛的國際交流與合作，促進了北醫(yī)的人才培養(yǎng)與醫(yī)學科學研究的進展。

2000年與北京大學合校后，北京大學醫(yī)學部本著“實事求是”與“發(fā)展是硬道理”的原則，采取條塊結(jié)合，以塊為主的管理模式，利用合校后的學科綜合優(yōu)勢，不斷發(fā)展學科建設(shè)，推動醫(yī)學教育改革與科學研究，努力改善基礎(chǔ)設(shè)施條件。啟動并不斷探索醫(yī)學、藥學與預(yù)防醫(yī)學學生長學制的培養(yǎng)模式，大力推進醫(yī)學學科與理科、人文社會學科的交叉，學科建設(shè)得到有力加強，學科布局進一步優(yōu)化，促進了基礎(chǔ)醫(yī)學與臨床醫(yī)學、醫(yī)學和藥學、預(yù)防和治療的結(jié)合，促進了生物醫(yī)學與數(shù)學、物理、化學、力學、電子學等多學科的交叉。近年來，在“211工程”和“985工程”的支持下，北京大學醫(yī)學部進入了一個新的歷史發(fā)展階段，在學科建設(shè)、人才培養(yǎng)、師資隊伍建設(shè)、教學科研等各方面都取得了顯著成績，為將北大建設(shè)成為世界大學奠定了堅實的基礎(chǔ)。今天的醫(yī)學部已經(jīng)成為國家培養(yǎng)高素質(zhì)、創(chuàng)造性人才的搖籃、科學研究的前沿和知識創(chuàng)新的重要基地和國際交流的重要橋梁和窗口。在此基礎(chǔ)上，醫(yī)學部完善和建立了一批科研和技術(shù)平臺，同時根據(jù)學科發(fā)展和重大疾病防治研究的需要，利用北京大學學科齊全的綜合優(yōu)勢，成立了衰老研究中心、感染病研究中心、系統(tǒng)生物醫(yī)學研究所、交通醫(yī)學中心、疼痛醫(yī)學中心、睡眠醫(yī)學中心等研究機構(gòu)。北京大學生物醫(yī)學跨學科研究中心得到進一步發(fā)展，臨床研究所、醫(yī)學信息學中心、中國衛(wèi)生發(fā)展研究中心、國家醫(yī)療數(shù)據(jù)中心等相繼成立，為開展多學科或跨學科合作研究、面向國家重大需求與承擔國家重大任務(wù)創(chuàng)造了更加有利的條件。

今天的北京大學醫(yī)學部正在飛速發(fā)展，這所由中國政府于1912年創(chuàng)立的第一所醫(yī)學院校，在國家的大力支持下，秉承“勤奮，嚴謹，求實，創(chuàng)新”的學風和“堅定正確的政治方向，嚴謹求實的治學態(tài)度，熱忱服務(wù)的獻身精神”的校風，以更堅實有力的步伐，在創(chuàng)建世界大學的進程中再創(chuàng)輝煌，實現(xiàn)她自己的最高目標：盡其所能，為了人類健康事業(yè)的發(fā)展，創(chuàng)造世界的醫(yī)學教育事業(yè)。