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中華中醫(yī)藥學會肛腸分會成立前身是在六十年代初，衛(wèi)生部召集中國中醫(yī)研究院及全國20余家中醫(yī)院校的中醫(yī)肛腸專家和一部分西醫(yī)肛腸專家在中醫(yī)研究院召開了中醫(yī)治療痔瘺成果座談會，通過評定，充分肯定了中醫(yī)治療痔瘺療法的臨床療效。會上成立了全國中西醫(yī)結合防治肛腸疾病協(xié)作組，本次會議上成立的全國中西醫(yī)結合防治肛腸疾病協(xié)作組就是全國肛腸分會的前身。

1975年，由中國中醫(yī)研究院廣安門醫(yī)院主持在河北省衡水地區(qū)召開了第一次全國中西醫(yī)結合防治肛腸疾病協(xié)作組會議。會議確定每三年召開一次全國中醫(yī)肛腸學術會議。專題研討會每年一次。迄今為止已召開12次全國中醫(yī)肛腸學術會議醫(yī)學|教育網整理。每次會議代表均達400-500余人，論文500-600余篇。參會人員有中醫(yī)、中西醫(yī)結合和部分西醫(yī)肛腸專家，以及各地區(qū)肛腸醫(yī)師、科教人員和基礎醫(yī)學研究者。由于每次全國大會均集中了肛腸學科的學術精英，所以每次會議出版的論文匯編均顯示出了相當高的學術水平，會上學術研討的氣氛也非�；钴S，對我國肛腸學研究起到了極大的促進作用。1977年，在南京召開了第二次全國中醫(yī)肛腸學術會議。出席會議的有來自全國各中醫(yī)單位的200余名代表。