（1）熱原質：大多數(shù)為革蘭陰性菌合成的菌體脂多糖醫(yī)學教育網|搜集整理。注入人體或動物體內能引起發(fā)熱反應，故稱熱原質。

（2）毒素和侵襲性酶：細菌產生毒素，包括內毒素和外毒素。內毒素為草蘭陰性菌的脂多糖。外毒素是革蘭陽性菌產生的蛋白質，毒性強且有高度的選擇性。有些細菌還能產生具有侵襲性的酶，如卵磷脂酶、透明質酸酶等。毒素和侵襲性酶在細菌致病性中甚為重要。

（3）色素：有水溶性色素（銅綠假單胞菌的色素）和脂溶性色素（金黃色葡萄球菌的色素）。不同細菌產生不同的色素，在鑒別細菌上有一定意義。

（4）抗生素：是由某些微生物代謝過程中產生的、能抑制或殺死另一些微生物和癌細胞的微量生物活性物質。

（5）細菌素：某些細菌菌株產生的一類具有抗菌作用的蛋白質，細菌素作用范圍狹窄，僅對與產生該種細菌素的細菌有近緣關系的細菌才能起作用，如大腸菌素、綠膿菌素、變形菌素和弧菌素等。

（6）維生素。