影響秦艽瀕危的原因較多，只有那些直接或間接導(dǎo)致種群衰退的因素才算致危因素。不同的致危因素以其不同作用方式對(duì)中藥秦艽個(gè)體、種群或生態(tài)環(huán)境進(jìn)行著長(zhǎng)期而廣泛的危害，分析生境條件和影響其生長(zhǎng)發(fā)育的因素，最主要的致危因素有以下幾種：

中藥秦艽主要靠種子進(jìn)行繁殖，經(jīng)實(shí)驗(yàn)研究種子萌發(fā)的最佳溫度是20～25℃之間(每年的4月下旬，日最高溫度一般超過20℃，此時(shí)播種較適宜)。種子萌發(fā)率第1年為70%左右，第2年下降到20%。實(shí)驗(yàn)證明，秦艽種子的壽命為1年，隔年種子在自然條件下保存發(fā)芽率低。如果播種后當(dāng)年春旱持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng)或雨季來臨過遲，則會(huì)影響種子的萌發(fā)，對(duì)秦艽的小種群造成不同程度的危害。外在因素森林砍伐、墾荒、放牧、采挖是對(duì)秦艽種群生境的徹底破壞。人為干擾因素越大，生境條件越差，種群衰退越強(qiáng)。從表面看，森林破壞、草原沙化似乎不直接減少秦艽種群數(shù)量，降低種群生殖、生活能力，實(shí)際上這恰恰導(dǎo)致了秦艽種群生境條件從根本上惡化，限制了秦艽種群生存的發(fā)展。輕度放牧一方面通過牲畜的踩踏、取食，破壞了秦艽群落，另一方面則直接取食其地上部分—莖、葉、花、果，導(dǎo)致秦艽個(gè)體生長(zhǎng)衰退，失去當(dāng)年的繁殖能力。也毀滅了被采食的群落。

當(dāng)?shù)剞r(nóng)牧民采挖秦艽根，導(dǎo)致秦艽種群數(shù)量直接減少。秦艽一般需3～6年方可長(zhǎng)成，而祁連山地區(qū)則需8～10年以上，這些生長(zhǎng)在自然條件較差的環(huán)境中，毀一個(gè)個(gè)體就等于毀一個(gè)種源，也毀掉種群未來發(fā)展的一部分后續(xù)資源。再加上采挖時(shí)對(duì)幼齡個(gè)體的踐踏，對(duì)種群的損害遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出采挖的個(gè)體導(dǎo)致種群個(gè)體絕對(duì)數(shù)量減少所造成的危害。人為干擾與破壞是瀕危最主要的原因。

綜上所述，秦艽的瀕危過程是其內(nèi)在因素和外部不良因素綜合作用的結(jié)果。