非洲錐蟲病的病原體有兩種：羅得西亞錐蟲和岡比亞錐蟲，兩者皆為布氏錐蟲（T.b.brucei）亞種。布氏錐蟲為野生動物錐蟲病的病原體，一般不感染人醫(yī)學|教育網搜索整理。

錐蟲在人體主要寄生于血液和組織間隙，為細長鞭毛體，扁平彎曲，前端尖細有鞭毛，后端較圓。在人體內形態(tài)多變，自8～35×1.5～3.5（μm）不等。初感染時為細長型，細胞核位于蟲體中央，動基體位于后端，鞭毛長；繼而變?yōu)榇侄绦?，細胞核位于原蟲后端，鞭毛短，甚至缺如。