消化道中的正常菌群的種類和數(shù)量，在不同部位是不同的。胃酸的酸度很高（pH2～3），因而胃內基本無活菌?？漳c和回腸上部的菌群很少。結腸和直腸則有大量細菌，主要是類桿菌（Bacteroides）、雙歧桿菌（Bifidobacterium）、大腸埃希氏菌、乳桿菌、銅綠假單胞菌、變形桿菌（Proteus）、梭菌（Clostridium）等。1克干糞含菌總數(shù)在4千億個左右，約占糞重的40%，其中99%以上是厭氧菌。腸道菌群受飲食、年齡等因素影響很大。多食蛋白質的人，大腸埃希氏菌生長旺盛；以吃淀粉為主的人，乳桿菌較多。哺乳期嬰兒的腸道菌群主要是雙歧桿菌，占總菌數(shù)的90%左右；隨著成長，雙歧桿菌下降，類桿菌、乳桿菌、梭菌等逐漸增多醫(yī)學教`育網(wǎng)搜集整理。

　　嬰兒剛出生時腸道是無菌的，1～2小時后就有菌出現(xiàn)。開始時菌種和數(shù)量少，隨后逐步增多。先定殖的是需氧菌，然后是厭氧菌。因前者生長繁殖需消耗周圍微環(huán)境中的游離氧，這有利于厭氧菌的繁殖。此過程約1周左右。