百日咳桿菌為短桿狀或橢圓型，長約0.3～0.5mm.革蘭氏染色陰性，兩端著色較深。該菌為需氧菌，最適生長溫度為35℃~37℃，最適PH值為6.8～7.0.初次分離的菌株在包—姜（Bordet-Gengou）培養(yǎng)基上培養(yǎng)2～3天后，呈細小、光滑、凸起和銀灰色、不透明的珍珠狀菌落，周圍有不明顯的溶血環(huán)。在液體培養(yǎng)基中成混濁生長，管底有少量粘性沉淀。

　　百日咳桿菌常發(fā)生光滑型（Smooth Form）至粗糙型（Rough Form）的變異，即S—R變異，稱為相變異。I相菌為S型，Ⅱ相菌和Ⅲ相菌為過度型，Ⅳ相菌為R型。一般在疾病急性期初次分離的菌為I相，在疾病晚期或多次傳代后可出現(xiàn)Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ相變異。故制備百日咳疫苗及凝集試驗用菌液均使用百日咳I相菌。

　　百日咳桿菌對一般理化因子抵抗力甚弱醫(yī)學(xué)`教育網(wǎng)搜集整理，56℃30分鐘、日照1小時即可致死。在干燥塵埃中能存活3天。對氯霉素，紅霉素等敏感，對青霉素和磺氨藥有抵抗力。