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徐州醫(yī)學院藥學院由 1997年學校開辦的江蘇省首家臨床藥學專業(yè)方向發(fā)展而來，2001年成立臨床藥學系，2005年更名為藥學系，2008年正式更名為藥學院?，F(xiàn)擁有藥學、臨床藥學、藥物制劑3個本科專業(yè)，已培養(yǎng)藥學類專業(yè)人才1000余人。2008年，藥學本科專業(yè)成為國家特色專業(yè)建設點和江蘇省特色專業(yè)。2012年，藥學院的藥學、臨床藥學、藥物制劑3個本科專業(yè)組成的藥學類專業(yè)獲批成為江蘇省“十二五”重點專業(yè)類。現(xiàn)有江蘇省藥學基礎課實驗教學示范中心和江蘇省藥學實踐教育中心。2010年，藥學一級學科獲得碩士學位授予權(quán)，目前藥理學、藥物化學、藥物分析學、藥劑學和臨床藥學5個二級學科招收碩士研究生，同年，糖尿病并發(fā)癥的藥物防治成為江蘇省優(yōu)勢學科生物學的主要研究方向之一。目前在校生1000余人。