（一）機(jī)械的阻擋和排除作用

健康和完整的皮膚與粘膜能有效地阻擋細(xì)菌的侵入。呼吸道粘膜上皮細(xì)胞的纖毛向上顫動(dòng)，可將細(xì)菌咳出或咽下；隨糞便每日約排菌1012個(gè)；小便可清除尿道上皮的細(xì)菌。

（二）分泌液中化學(xué)物質(zhì)的局部抗菌作用

汗腺分泌的乳酸，皮脂腺分泌的脂肪酸均有一定的抗菌作用。胃酸能殺死寒桿菌、痢疾桿菌和霍亂弧菌。陰道分泌物中的酸類亦有抗菌作用。前列腺分泌的精素（Spermine）是正常精液中存大的對革蘭氏陽性細(xì)菌有效的抑制物。淚液、唾液、乳汗和呼吸道分泌物中廣泛分布的溶菌酶能溶解革蘭氏陽性細(xì)菌。

（三）正常菌群的拮抗作用

人體表以及與外界相通腔道中的正常菌群，可以通過它們的代謝產(chǎn)物對抗病原菌入侵。例如皮膚上的痤瘡丙酸菌（Propionibacterium acnes）能產(chǎn)生抗菌性脂類、抑制金黃色葡萄球菌和化膿性鏈球菌在皮膚上生長；腸道中的某些厭氧菌能產(chǎn)生脂肪酸阻止沙門氏菌在局部生存；腸道中大腸桿菌產(chǎn)生的大腸菌毒和酸性產(chǎn)物能抑制痢疾桿菌、金黃色葡萄球菌；咽部的草綠色鏈球菌似能阻止肺炎球菌在局部生長；鼻腔的表皮葡萄球菌和類白喉?xiàng)U菌能妨礙金黃色葡萄球菌定居等。當(dāng)這種拮抗作用受影響時(shí)，則可發(fā)生菌群失調(diào)癥。