會議日期 | 2022-05-14至 2022-05-15 |
會議地點 | 北京豐臺區(qū) |
會議學科 | 科研/教育科研申報 |
主辦單位 | 北京華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司 |
學分情況 |
2022年5月14日-15日
騰訊會議客戶端線上授課(非錄播)
二、授課老師:
來自中科院,長期從事單細胞多組學方面的項目研究,目前已在Nature等雜志發(fā)表文章四十多篇,承擔國家科技部、國家自然基金委和重點研發(fā)計劃等多項課題。
三、會議特色:
本次課程以近期CNS文章為案例主線,逐一詳細剖析,全程電腦實戰(zhàn)教學。理論與實踐相結(jié)合,老師將以最簡單易懂的方式,既介紹單細胞測序的研究方法、分析內(nèi)容和最新前沿進展,又介紹具體的數(shù)據(jù)庫、工具和軟件的使用,并在課堂上進行上機指導。講師經(jīng)驗豐富,教學深入淺出,能讓大家獲得從單細胞組學原始數(shù)據(jù)實現(xiàn)CNS圖形繪制的實戰(zhàn)能力。
四、預期目標:
本學習班由多年從事單細胞組學研究的科研人員授課,通過深入淺出的理論講解和實例案例,幫助學員拓展研究思路,提升科研水平,增加職業(yè)競爭力。通過本次課程培訓將使學員系統(tǒng)掌握當前主流的單細胞組學分析流程、方法和軟件,從零基礎實現(xiàn)到CNS圖表的繪制,同時提升研究深度和廣度,拓寬研究思路。
五、主要內(nèi)容:
1.熟悉單細胞組學圖表解讀和研究思路。
2.掌握單細胞組學分析標準流程和常用軟件。
3.熟悉單細胞數(shù)據(jù)的分型和marker基因鑒定。
4.掌握單細胞數(shù)據(jù)的軌跡分析及功能富集分析。
5.了解單細胞課題設計方法及研究思路。
6.熟悉并掌握單細胞空間轉(zhuǎn)錄組學實用技能。
六、課程安排:
日期
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時間
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授課題目
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授課內(nèi)容
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5月14日
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9:00-12:00
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單細胞測序技術(shù)與應用 | 1. 單細胞組學技術(shù)的發(fā)展和原理。 2. 單細胞在各個科研領(lǐng)域的應用。 3. 單細胞高分文章分析思路解析(細胞群鑒定、擬時序分析、差異表達、功能富集、轉(zhuǎn)錄因子、細胞通訊等)。 4. 單細胞組學分析常用數(shù)據(jù)庫介紹及使用。 |
12:00-14:00
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午間休息
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14:00-17:00
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單細胞組學數(shù)據(jù)分析實操 | 1. R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。 2. R語言語法介紹及常用命令。 3. R語言的數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計應用。 4. 10X官方單細胞軟件Cellranger講解及實操。 5. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 6. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 7. 單細胞轉(zhuǎn)錄組細胞鑒定及聚類分析。 8. 單細胞轉(zhuǎn)錄組差異分析。 |
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5月15日
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9:00-12:00
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單細胞轉(zhuǎn)錄組軌跡、通路、轉(zhuǎn)錄因子等分析及繪圖實操 | 1. 通過Seurat 合并多樣本及消除樣本異質(zhì)性。 2. 通過Monocle軟件進行單細胞轉(zhuǎn)錄組擬時間分析。 3. 通過DAVID及metascape網(wǎng)站進行通路富集分析。 4. 通過GSVA計算細胞通路得分信號等。 5. 通過cellphonedb進行細胞互作分析。 6. 通過infercnv推斷染色體拷貝數(shù)變異。 7. 通過SCENIC軟件進行轉(zhuǎn)錄因子預測分析。 |
12:00-14:00
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午間休息
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14:00-17:00
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空間轉(zhuǎn)錄組+單細胞測序聯(lián)合分析 | 1. 空間轉(zhuǎn)錄組基本概念及原理。 2. 單細胞及空間轉(zhuǎn)錄組研究思路及案例分享。 3. 單細胞和空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合課題設計。 4. 空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析。 5. 通過Seurat進行空間變量特征的識別。 6. 與單細胞數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析(空間細胞類型定義)。 7. 通過Seurat處理多個切片。 |
會議費3000元/人,此次課程為線上直播教學模式,開課前統(tǒng)一提供配套電子版培訓資料。參加培訓的學員課后可通過微信群繼續(xù)和授課講師交流,長期獲得指導機會。
課程結(jié)束后統(tǒng)一快遞紙質(zhì)版蓋章通知和正式發(fā)票,如提前需要請聯(lián)系會務組。
本次會議費委托合肥華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會務發(fā)票。
1.網(wǎng)上匯款或銀行轉(zhuǎn)賬
戶 名:合肥華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司
開戶行:中國銀行合肥臨泉路支行
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2.支付寶賬號
名字:合肥華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司
賬號:kf@Huasitai.com
注:匯款時請務必注明“單細胞”和學員姓名,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認。
聯(lián)系人:章老師
電 話:13121195178(微信同號)
E-mail:info@huasitai.com
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